rdkit.Chem package

Subpackages

• rdkit.Chem.AtomPairs package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.AtomPairs.Pairs module
    • rdkit.Chem.AtomPairs.Sheridan module
    • rdkit.Chem.AtomPairs.Torsions module
    • rdkit.Chem.AtomPairs.Utils module
  • Module contents
• rdkit.Chem.ChemUtils package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.ChemUtils.AlignDepict module
    • rdkit.Chem.ChemUtils.BulkTester module
    • rdkit.Chem.ChemUtils.DescriptorUtilities module
    • rdkit.Chem.ChemUtils.SDFToCSV module
    • rdkit.Chem.ChemUtils.TemplateExpand module
  • Module contents
• rdkit.Chem.Draw package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.Draw.IPythonConsole module
    • rdkit.Chem.Draw.MolDrawing module
    • rdkit.Chem.Draw.SimilarityMaps module
    • rdkit.Chem.Draw.rdMolDraw2D module
    • rdkit.Chem.Draw.aggCanvas module
    • rdkit.Chem.Draw.cairoCanvas module
    • rdkit.Chem.Draw.canvasbase module
    • rdkit.Chem.Draw.mplCanvas module
    • rdkit.Chem.Draw.qtCanvas module
  • Module contents
• rdkit.Chem.EState package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.EState.AtomTypes module
    • rdkit.Chem.EState.EState module
    • rdkit.Chem.EState.EState_VSA module
    • rdkit.Chem.EState.Fingerprinter module
  • Module contents
• rdkit.Chem.FeatMaps package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.FeatMaps.FeatMapParser module
    • rdkit.Chem.FeatMaps.FeatMapPoint module
    • rdkit.Chem.FeatMaps.FeatMapUtils module
    • rdkit.Chem.FeatMaps.FeatMaps module
  • Module contents
• rdkit.Chem.Features package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.Features.FeatDirUtilsRD module
    • rdkit.Chem.Features.ShowFeats module
  • Module contents
• rdkit.Chem.Fingerprints package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.Fingerprints.ClusterMols module
    • rdkit.Chem.Fingerprints.DbFpSupplier module
    • rdkit.Chem.Fingerprints.FingerprintMols module
    • rdkit.Chem.Fingerprints.MolSimilarity module
    • rdkit.Chem.Fingerprints.SimilarityScreener module
  • Module contents
• rdkit.Chem.Fraggle package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.Fraggle.FraggleSim module
  • Module contents
• rdkit.Chem.MolDb package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.MolDb.FingerprintUtils module
    • rdkit.Chem.MolDb.Loader module
    • rdkit.Chem.MolDb.Loader_orig module
    • rdkit.Chem.MolDb.Loader_sa module
  • Module contents
• rdkit.Chem.MolKey package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.MolKey.InchiInfo module
    • rdkit.Chem.MolKey.MolKey module
  • Module contents
• rdkit.Chem.Pharm2D package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.Pharm2D.Generate module
    • rdkit.Chem.Pharm2D.Gobbi_Pharm2D module
    • rdkit.Chem.Pharm2D.LazyGenerator module
    • rdkit.Chem.Pharm2D.Matcher module
    • rdkit.Chem.Pharm2D.SigFactory module
    • rdkit.Chem.Pharm2D.Utils module
  • Module contents
• rdkit.Chem.Pharm3D package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.Pharm3D.EmbedLib module
    • rdkit.Chem.Pharm3D.ExcludedVolume module
    • rdkit.Chem.Pharm3D.Pharmacophore module
  • Module contents
• rdkit.Chem.Scaffolds package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.Scaffolds.MurckoScaffold module
    • rdkit.Chem.Scaffolds.ScaffoldTree module
  • Module contents
• rdkit.Chem.SimpleEnum package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.SimpleEnum.Enumerator module
  • Module contents
• rdkit.Chem.Subshape package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.Subshape.BuilderUtils module
    • rdkit.Chem.Subshape.SubshapeAligner module
    • rdkit.Chem.Subshape.SubshapeBuilder module
    • rdkit.Chem.Subshape.SubshapeObjects module
    • rdkit.Chem.Subshape.testCombined module
  • Module contents
• rdkit.Chem.Suppliers package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.Suppliers.DbMolSupplier module
    • rdkit.Chem.Suppliers.MolSupplier module
  • Module contents
• rdkit.Chem.fmcs package
  • Submodules
    • rdkit.Chem.fmcs.fmcs module
  • Module contents

Submodules

• rdkit.Chem.AllChem module
• rdkit.Chem.BRICS module
• rdkit.Chem.BuildFragmentCatalog module
• rdkit.Chem.ChemicalFeatures module
• rdkit.Chem.ChemicalForceFields module
• rdkit.Chem.Crippen module
• rdkit.Chem.DSViewer module
• rdkit.Chem.Descriptors module
• rdkit.Chem.Descriptors3D module
• rdkit.Chem.EnumerateHeterocycles module
• rdkit.Chem.EnumerateStereoisomers module
• rdkit.Chem.FastSDMolSupplier module
• rdkit.Chem.FeatFinderCLI module
• rdkit.Chem.FilterCatalog module
• rdkit.Chem.FragmentCatalog module
• rdkit.Chem.FragmentMatcher module
• rdkit.Chem.Fragments module
• rdkit.Chem.FunctionalGroups module
• rdkit.Chem.GraphDescriptors module
• rdkit.Chem.Graphs module
• rdkit.Chem.Lipinski module
• rdkit.Chem.MACCSkeys module
• rdkit.Chem.MCS module
• rdkit.Chem.MolCatalog module
• rdkit.Chem.MolStandardize module
  • Submodules
    • rdkit.Chem.MolStandardize.rdMolStandardize module
• rdkit.Chem.MolSurf module
• rdkit.Chem.PandasTools module
• rdkit.Chem.PeriodicTable module
• rdkit.Chem.PropertyMol module
• rdkit.Chem.PyMol module
• rdkit.Chem.QED module
• rdkit.Chem.Randomize module
• rdkit.Chem.Recap module
• rdkit.Chem.ReducedGraphs module
• rdkit.Chem.SATIS module
• rdkit.Chem.SaltRemover module
• rdkit.Chem.ShowMols module
• rdkit.Chem.TemplateAlign module
• rdkit.Chem.TorsionFingerprints module
• rdkit.Chem.inchi module
• rdkit.Chem.rdchem module
• rdkit.Chem.rdDistGeom module
• rdkit.Chem.rdqueries module
• rdkit.Chem.rdFMCS module
• rdkit.Chem.rdMolAlign module
• rdkit.Chem.rdMolHash module
• rdkit.Chem.rdReducedGraphs module
• rdkit.Chem.rdtrajectory module
• rdkit.Chem.rdMolTransforms module
• rdkit.Chem.rdmolfiles module
• rdkit.Chem.rdPartialCharges module
• rdkit.Chem.rdMolCatalog module
• rdkit.Chem.rdCoordGen module
• rdkit.Chem.rdMolChemicalFeatures module
• rdkit.Chem.rdMMPA module
• rdkit.Chem.rdRGroupDecomposition module
• rdkit.Chem.rdForceFieldHelpers module
• rdkit.Chem.rdDepictor module
• rdkit.Chem.rdChemicalFeatures module
• rdkit.Chem.rdmolops module
• rdkit.Chem.rdFreeSASA module
• rdkit.Chem.rdMolInterchange module
• rdkit.Chem.rdShapeHelpers module
• rdkit.Chem.rdinchi module
• rdkit.Chem.rdChemReactions module
• rdkit.Chem.rdSubstructLibrary module
• rdkit.Chem.rdfiltercatalog module
• rdkit.Chem.rdfragcatalog module
• rdkit.Chem.rdStructChecker module
• rdkit.Chem.rdMolDescriptors module
• rdkit.Chem.rdFingerprintGenerator module
• rdkit.Chem.rdSLNParse module

Module contents